Edouard Marie Heckel est né à Toulon de parents d’origine alsacienne. Il est admis en 1859 à l’âge de 16 ans à l’Ecole de médecine navale de Toulon.
Il part pour les Antilles en 1861 comme pharmacien adjoint-major. Il voyage beaucoup et acquiert au cours de ces voyages une expertise en botanique tropicale et en phytothérapie... De retour en France, il passe son doctorat en médecine à Montpellier et entame une carrière universitaire à Montpellier (1873), Nancy (1873-1876), Grenoble(1876) et arrive à Marseille en 1877.
Il sera professeur de de 1879 à 1913, date de sa retraite, professeur de matière médicale à l’école préparatoire de Médecine.. En 1893 il crée l’Institut de Médecine coloniale et le Musée colonial,. Il crée également le jardin botanique du Parc Borely dont il sera le directeur de 1890 à 1916, date de son décès.
En 1906 il sera l’ardent administrateur aux côtés de JJ Charles Roux de la première exposition coloniale de Marseille. Le succès fut international et la ville en acquit un grand prestige. Il sera aussi conseiller municipal de Marseille et conseiller général du Var. Il est enterré au cimetière du Castellet.